PHP.ini 有个值 max_input_vars 默认是 1000 
可能和版本有关，我的（php 5.5）是 2500

变量的解释是： 
How many GET/POST/COOKIE input variables may be accepted

所以他导致的问题是 最多能接受 1000个变量 
同理适用于 函数 parse_str(string,array)

<?php
parse_str("name=Bill&age=60",$myArray);
print_r($myArray);
?>

而magento 后台在分类页 将产品分到某个分类下就是采用了 parse_str 的方法  由此产生的问题就是 最多能将某个分类保存 1000或者1001 个产品。再多了 就会报错

Warning: parse_str(): Input variables exceeded 1000. To increase the limit change max_input_vars in php.ini.  in /app/code/core/Mage/Adminhtml/controllers/Catalog/CategoryController.php on line 310

所以最直接的解决办法是 增大 max_input_vars 的值  但是 始终会有瓶颈。

更改程序

修改 文件：

app\code\core\Mage\Adminhtml\controllers\Catalog\CategoryController.php 的函数 saveAction()

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其中一段 if 程序修改为：

“`  if (isset(data['category_products']) && !category->getProductsReadonly()) {  products=array();exploded = explode('&', $data[‘category_products’]);

foreach ($exploded as $row) {
    $temp = array();
    parse_str($row, $temp);
    list($key, $value) = each($temp);
    if(!empty($key)) {
        $products[$key] = $value;
    }
}

$category->setPostedProducts($products);

}

相信你可以知道修改的程序具体位置在哪里 ：）“`